Есть виртуальная таблица Остатки и ЛЕВОЕ соединение с документом. В итоге получаю только записи, которые есть в документе.
ОБЪЕДИНИТЬ не предлагать - в документе есть признак группировки, которого нет в Остатки.
Для подмены использую ЕСТЬNULL(Признак,Спр.Признаки.ПустаяСсылка)
Как получить правильно ВСЕ остатки и колонку Количество из документа?
Если не понятно - могу весь запрос показать.

Показывай

 ВЫБРАТЬ РАЗРЕШЕННЫЕ
	ХозрасчетныйОстатки.Организация,
	ВЫРАЗИТЬ(ХозрасчетныйОстатки.Субконто2 КАК Справочник.Склады) КАК Склад,
	ВЫРАЗИТЬ(ХозрасчетныйОстатки.Субконто1 КАК Справочник.Номенклатура) КАК Номенклатура,
	ЕСТЬNULL(РаспределениеЗапасовТовары.Ссылка.КомуПереходит, ЗНАЧЕНИЕ(Справочник.ПризнакиДляРазделения.ПустаяСсылка)) КАК КомуПереходит,
	СУММА(ЕСТЬNULL(РаспределениеЗапасовТовары.Количество, 0)) КАК КвоПотребн,
	СУММА(ХозрасчетныйОстатки.КоличествоОстаток) КАК КвоОстаток,
	СУММА(ХозрасчетныйОстатки.СуммаОстаток) КАК СуммаОстаток,
	"+" КАК Фильтр
ПОМЕСТИТЬ Товары
ИЗ
	РегистрБухгалтерии.Хозрасчетный.Остатки(, Счет В ИЕРАРХИИ (&Счета), , ) КАК ХозрасчетныйОстатки
		ЛЕВОЕ СОЕДИНЕНИЕ Документ.РаспределениеЗапасов.Товары КАК РаспределениеЗапасовТовары
		ПО ХозрасчетныйОстатки.Организация = РаспределениеЗапасовТовары.Ссылка.Организация
			И ((ВЫРАЗИТЬ(ХозрасчетныйОстатки.Субконто1 КАК Справочник.Номенклатура)) = РаспределениеЗапасовТовары.Номенклатура)
			И ((ВЫРАЗИТЬ(ХозрасчетныйОстатки.Субконто2 КАК Справочник.Склады)) = РаспределениеЗапасовТовары.Склад)
ГДЕ
	РаспределениеЗапасовТовары.Ссылка.Дата МЕЖДУ НАЧАЛОПЕРИОДА(&Период, МЕСЯЦ) И &Период
	И НЕ РаспределениеЗапасовТовары.Ссылка.ПометкаУдаления

СГРУППИРОВАТЬ ПО
	ВЫРАЗИТЬ(ХозрасчетныйОстатки.Субконто1 КАК Справочник.Номенклатура),
	ВЫРАЗИТЬ(ХозрасчетныйОстатки.Субконто2 КАК Справочник.Склады),
	ХозрасчетныйОстатки.Организация,
	ЕСТЬNULL(РаспределениеЗапасовТовары.Ссылка.КомуПереходит, ЗНАЧЕНИЕ(Справочник.ПризнакиДляРазделения.ПустаяСсылка))
;

////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
ВЫБРАТЬ
	Товары.Организация,
	Товары.Склад,
	Товары.КомуПереходит,
	Товары.Фильтр,
	Товары.Номенклатура,
	СУММА(Товары.КвоПотребн) КАК КвоПотребн,
	СУММА(Товары.КвоОстаток) КАК КвоОстаток,
	СУММА(Товары.СуммаОстаток) КАК СуммаОстаток,
	СУММА(Товары.КвоОстаток - Товары.КвоПотребн) КАК Дельта
ИЗ
	Товары КАК Товары

СГРУППИРОВАТЬ ПО
	Товары.Организация,
	Товары.Склад,
	Товары.Номенклатура,
	Товары.Фильтр,
	Товары.КомуПереходит 

Весь запрос в студию.

(4) Хорошо, мне нужны не все документы, а только за прошедший месяц
Ага, вроде понял... щас

Внутренним запросом отсеки все ненужное в документах, потом соединяй с остатками.

(6) Та понял уже... я наложил условие на ВСЮ выборку :)